TMT同位素标记定量技术
该技术采用2种、6种或10种同位素的标签，特异性标记多肽的氨基基团，经过串联质谱LC-MS/MS分析，可同时比较2组，6组或最多10组不同样品中蛋白质的相对含量。
PMF 鉴定(肽质量指纹图谱鉴定)
来源于电泳的蛋白点，蛋白条带，或者液相制备的纯品固体，液体等，经过适当酶解后，通过高效液相 HPLC，或者质谱 MS进行酶切组分的质量谱检测。
蛋白质谱测序
用 Nano-LC-ESI-MS/MS蛋白鉴定技术和Label-Free定量技术对蛋白凝胶样本（SDS-PAGE样本）、IP、co-IP、Pull-down等纯化溶液样本进行蛋白鉴定。